疾控中心实验室污水处理设备的排水来源复杂，污水中含有病毒、细菌、化学物质、有机污染物等。直接排放对城市环境和公共卫生有潜在危害，应经污水处理站处理后再接入市政污水管网。

　　废水处理工艺为：化粪池格栅调节池MBR膜生物反应池氯消毒排放。

　　膜生物反应器用于污水处理，将传统活性污泥法与高效膜分离技术相结合。曝气池内放置独特结构的浸没式膜组件。水经过好氧曝气和生物处理后，通过MBR膜组件，经滤膜经泵过滤后抽出。MBR膜截留反应池中的大部分细菌、病毒和有机物，达到去除效果。

　　因为污水中有病毒和细菌，所以污水处理的核心是消毒。设计采用两级强化消毒。首先，污水在预消毒池中进行预消毒，然后对处理后的出水进行二次消毒。前端预消毒杀死水中大部分致病菌和病毒，末端消毒进一步增强消毒效果。

　　污水处理站化粪池和处理构筑物的污泥应由有资质的单位或部门定期收集。所有污泥应根据医疗废物处理要求进行有效消毒和集中处理(焚烧)。

　　实验室污水处理设备污水处理站的所有设备都是密封的，过滤器吸附器用于有效灭活废气处理中的空气传播类病毒。